Het vliegende deel van de VKS is georganiseerd in tactische luchtlegers, voluit Air Force and Air Defence Army (Russisch: Vozdushnaya Armiya VVS i PVO) — in deze leeromgeving kortweg AFADA. Elk AFADA combineert jacht-, slag- en transporteenheden mét de bijbehorende grondluchtverdediging in één geografisch district. Die combinatie van vliegen én luchtverdediging onder één commando is typisch Russisch en de kern van het IADS-denken (zie hoofdstuk 5).
Daarboven staan twee centraal aangestuurde commando's: de Long-Range Aviation (LRA) voor strategische bombardementen en de Military Transport Aviation (VTA) voor luchttransport. De hoofdstad wordt afzonderlijk beschermd door de 1st Special Purpose Air & Missile Defence Army (zie § 5.4).
| Commando | Militair district (na reorg 2024) | Hoofdkwartier |
|---|---|---|
| 6th AFADA | Leningrad MD | Sint-Petersburg |
| 1st PVO (Special Purpose) | Moskou MD | Moskou (raketafweer) |
| 4th AFADA | Southern MD | Rostov-aan-de-Don |
| 14th AFADA | Central MD | Jekaterinenburg |
| 11th AFADA | Eastern MD | Chabarovsk |
| 45th AFADA | Noordelijke Vloot (Arctisch) | Severomorsk |
| LRA (37th VA) | Centraal — strategisch | Moskou |
| VTA (61st VA) | Centraal — transport | Moskou |
5 tactische luchtlegers + 1st PVO (Moskou) · Long-Range Aviation · Military Transport Aviation · totale sterkte ± 160.000–165.000 · ± 4.000 toestellen (met aanzienlijke oorlogsverliezen).
In 2024 werd het grote Western Military District opgesplitst in een nieuw Leningrad MD (anti-NAVO, na de toetreding van Finland en Zweden) en een Moskou MD (onder meer voor de aansturing van de oorlog in Oekraïne). Het 6th AFADA valt sindsdien onder het Leningrad MD; de hoofdstedelijke luchtverdediging onder het Moskou MD. De oudere indeling met één Western MD is daarmee achterhaald.