De VKS hangt onder de Generale Staf en het Nationale Defensie Controlecentrum (NTsUO) in Moskou. Daaronder volgt de keten via district en commando naar de individuele eenheid.
Opperbevel / Generale Staf (Moskou)
Strategische aansturing, NTsUO-commandocentrum
Opperbevel VKS
Krijgsmachtdeel lucht & ruimte
Militair District / Joint Strategic Command (OSK)
Operationele aansturing in het district
AFADA — Command of Air Force & Air Defence
Tactisch luchtleger: vliegen + luchtverdediging
Divisie (lucht / luchtverdediging)
Bijv. 1st AD Division, 93rd AD Division
Regiment / Luchtbasis
Bijv. 22nd Guards Fighter Aviation Regiment
Squadron · SAM-regiment · radiotechnisch regiment
De uitvoerende eenheden — zie de AFADA-hoofdstukken
Kernpunt
Binnen één AFADA-divisie zitten vliegende regimenten, SAM-regimenten én radiotechnische (radar)regimenten naast elkaar. Dat is het organisatorische fundament onder het geïntegreerde luchtverdedigingssysteem (IADS): sensoren, jagers en raketten staan onder hetzelfde commando.